Fakultas Sains dan Teknologi UIN Syarif Hidayatullah Jakarta segera melakukan langkah-langkah Implementasi ISO. Proses menuju ISO ini FST berharap melakukan perbaikan-perbaikan pelayanan yang sesuai dengan Standar Manajemen Mutu yang diakui oleh Internasional. Standar ISO yang akan diusung oleh FST-UIN Jakarta adalah ISO 9001:2008 dimana Ruang Lingkup pada Realisasi Produk Jasa di Bidang Pendidikan/Fakultas/Jurusan/Program Studi.